FortiClient4.0系をインストールしてWebやメールができなくなった場合下記のサイトが参考に成ります。
STDMAN: FortiClient4.0系をインストールするとWebやメールができなくなる
　ちなみにこのサイトにあるコマンドプロンプトにて「net stop fortishield」を実行させますを行って
「サービスを停止できませんでした。」というメッセージが出た場合、タスクトレイの中にあるFortiClientを右クリック「管理者として実行」をして「シャットダウンFortiClient」を行うと良い…もしかしたら、コマンドプロンプトにて「net stop fortishield」を実行させますが省略可能なのかも知れません。